Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCB11O95342 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB11O95342 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB11O95342 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms