Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF6O94906 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF6O94906 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms