Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT38O76015 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT38O76015 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT38O76015 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT38O76015 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT38O76015 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT38O76015 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT38O76015 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT38O76015 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT38O76015 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT38O76015 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT38O76015 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT38O76015 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT38O76015 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT38O76015 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT38O76015 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT38O76015 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT38O76015 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT38O76015 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT38O76015 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT38O76015 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT38O76015 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT38O76015 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT38O76015 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT38O76015 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT38O76015 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT38O76015 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT38O76015 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT38O76015 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT38O76015 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT38O76015 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT38O76015 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT38O76015 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT38O76015 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT38O76015 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT38O76015 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT38O76015 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT38O76015 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT38O76015 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT38O76015 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT38O76015 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT38O76015 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT38O76015 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT38O76015 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT38O76015 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT38O76015 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT38O76015 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms