Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DCTN3O75935 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCTN3O75935 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms