Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRDM1O75626 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRDM1O75626 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM1O75626 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms