Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS26AO75436 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS26AO75436 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms