Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA2O75334 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PPFIA2O75334 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA2O75334 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms