Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB11FIP3O75154 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAB11FIP3O75154 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB11FIP3O75154 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms