Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC22O60826 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC22O60826 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms