Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PLIN3O60664 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN3O60664 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN3O60664 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms