Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEMFO60524 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEMFO60524 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEMFO60524 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEMFO60524 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEMFO60524 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEMFO60524 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEMFO60524 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEMFO60524 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEMFO60524 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEMFO60524 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMFO60524 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMFO60524 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMFO60524 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMFO60524 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMFO60524 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMFO60524 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMFO60524 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMFO60524 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMFO60524 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEMFO60524 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMFO60524 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMFO60524 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMFO60524 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMFO60524 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMFO60524 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMFO60524 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMFO60524 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMFO60524 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMFO60524 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEMFO60524 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEMFO60524 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMFO60524 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMFO60524 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMFO60524 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMFO60524 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMFO60524 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMFO60524 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEMFO60524 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMFO60524 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMFO60524 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMFO60524 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMFO60524 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMFO60524 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMFO60524 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMFO60524 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMFO60524 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEMFO60524 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMFO60524 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMFO60524 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMFO60524 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMFO60524 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMFO60524 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEMFO60524 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEMFO60524 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEMFO60524 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEMFO60524 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms