Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL4O60488 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms