Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NUPR1O60356 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUPR1O60356 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms