Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA5O60264 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA5O60264 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms