Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRC1O43663 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRC1O43663 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRC1O43663 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRC1O43663 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRC1O43663 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRC1O43663 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRC1O43663 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRC1O43663 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRC1O43663 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRC1O43663 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRC1O43663 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRC1O43663 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRC1O43663 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRC1O43663 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRC1O43663 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRC1O43663 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRC1O43663 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRC1O43663 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRC1O43663 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRC1O43663 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRC1O43663 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRC1O43663 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRC1O43663 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRC1O43663 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRC1O43663 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRC1O43663 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRC1O43663 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRC1O43663 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRC1O43663 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRC1O43663 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRC1O43663 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRC1O43663 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRC1O43663 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRC1O43663 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRC1O43663 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRC1O43663 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRC1O43663 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRC1O43663 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRC1O43663 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRC1O43663 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRC1O43663 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRC1O43663 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRC1O43663 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRC1O43663 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRC1O43663 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRC1O43663 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRC1O43663 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRC1O43663 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRC1O43663 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRC1O43663 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRC1O43663 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRC1O43663 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRC1O43663 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRC1O43663 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRC1O43663 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRC1O43663 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRC1O43663 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRC1O43663 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRC1O43663 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRC1O43663 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRC1O43663 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRC1O43663 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRC1O43663 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRC1O43663 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRC1O43663 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRC1O43663 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRC1O43663 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRC1O43663 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRC1O43663 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRC1O43663 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRC1O43663 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRC1O43663 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms