Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHMP2AO43633 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms