Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DENRO43583 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DENRO43583 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DENRO43583 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DENRO43583 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DENRO43583 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DENRO43583 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DENRO43583 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DENRO43583 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DENRO43583 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DENRO43583 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DENRO43583 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DENRO43583 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DENRO43583 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DENRO43583 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DENRO43583 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DENRO43583 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DENRO43583 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DENRO43583 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DENRO43583 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DENRO43583 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DENRO43583 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENRO43583 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENRO43583 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENRO43583 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENRO43583 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENRO43583 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENRO43583 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENRO43583 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DENRO43583 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DENRO43583 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
DENRO43583 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DENRO43583 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms