Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP8B1O43520 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP8B1O43520 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms