Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGSM2O43147 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGSM2O43147 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms