Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPTLC1O15269 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms