Protein–RNA interactions for Protein: O15247

CLIC2, Chloride intracellular channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC2O15247 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC2O15247 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC2O15247 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms