Protein–RNA interactions for Protein: O15055

PER2, Period circadian protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER2O15055 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PER2O15055 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PER2O15055 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PER2O15055 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PER2O15055 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PER2O15055 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PER2O15055 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PER2O15055 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PER2O15055 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PER2O15055 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PER2O15055 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PER2O15055 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PER2O15055 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PER2O15055 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PER2O15055 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PER2O15055 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PER2O15055 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PER2O15055 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PER2O15055 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PER2O15055 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PER2O15055 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PER2O15055 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PER2O15055 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PER2O15055 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PER2O15055 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PER2O15055 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PER2O15055 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PER2O15055 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PER2O15055 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PER2O15055 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PER2O15055 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms