Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2A1O14983 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2A1O14983 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2A1O14983 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms