Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITO14578 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITO14578 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITO14578 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITO14578 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITO14578 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITO14578 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CITO14578 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CITO14578 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CITO14578 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CITO14578 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CITO14578 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CITO14578 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CITO14578 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CITO14578 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CITO14578 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CITO14578 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CITO14578 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CITO14578 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CITO14578 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CITO14578 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CITO14578 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CITO14578 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CITO14578 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CITO14578 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CITO14578 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CITO14578 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CITO14578 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CITO14578 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CITO14578 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CITO14578 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CITO14578 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CITO14578 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CITO14578 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CITO14578 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CITO14578 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CITO14578 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CITO14578 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms