Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFXAPO00287 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFXAPO00287 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFXAPO00287 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms