Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0C1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0C1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0C1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0C1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0C1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0C1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0C1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0C1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0C1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H7C0C1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H7C0C1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H7C0C1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H7C0C1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0C1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0C1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C0C1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C0C1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C0C1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C0C1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C0C1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C0C1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C0C1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C0C1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C0C1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C0C1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms