Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA8SH3BPF8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA8SH3BPF8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms