Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPB9F8W1W9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms