Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
F8VP50 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8VP50 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8VP50 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8VP50 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8VP50 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8VP50 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8VP50 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8VP50 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8VP50 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8VP50 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8VP50 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
F8VP50 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8VP50 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8VP50 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8VP50 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8VP50 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
F8VP50 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8VP50 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8VP50 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8VP50 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8VP50 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8VP50 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms