Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L12C9JPN9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L12C9JPN9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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