Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MCRIP1C9JLW8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MCRIP1C9JLW8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms