Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PP2D1A8MPX8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms