Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTLL13PA6NNM8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTLL13PA6NNM8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms