Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPN8A6NHC0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN8A6NHC0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms