Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C5orf51A6NDU8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf51A6NDU8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms