Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM49BA6NDI0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM49BA6NDI0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49BA6NDI0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms