Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWA3AA6NCI4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA3AA6NCI4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms