Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT1A5YKK6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNOT1A5YKK6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT1A5YKK6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT1A5YKK6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT1A5YKK6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT1A5YKK6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT1A5YKK6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT1A5YKK6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT1A5YKK6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT1A5YKK6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT1A5YKK6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms