Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCHNA4D1U4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LCHNA4D1U4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms