Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRD1A4D1F6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRD1A4D1F6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms