Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIPSLA2A3N6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms