Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEB3A0JP26 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POTEB3A0JP26 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POTEB3A0JP26 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms