Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IGKV1-27A0A075B6S5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IGKV1-27A0A075B6S5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms