Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USP35Q9P2H5 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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