Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF449Q6P9G9 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms