Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AGAP9Q5VTM2 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AGAP9Q5VTM2 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms