Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMTNP53814 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMTNP53814 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMTNP53814 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms