Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 HCG2040054-202ENST00000439182 362 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms