Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC27P30260 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC27P30260 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC27P30260 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms