Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN2P17655 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms